Hervorgehoben wird seine Spezialisierung auf die Implantation künstlicher Kniegelenke, auch mit der minimal-invasiven Methode. Prof. Siebert ist des Weiteren Experte für schwierige Operationen zum Wechsel von künstlichen Gelenken und verfügt über umfangreiche Erfahrungen in der arthroskopischen Chirurgie.
Der Focus zählt Prof. Werner Siebert auch zu den Deutschland weit führenden acht Hüftspezialisten und verweist auf seine zusätzliche Spezialisierung auf Erstimplantationen, Wechseloperationen und bei anderen schwierigen Operationen, z. B. bei vollständigen Oberschenkelknochenersatz.
Unter der Leitung von Prof. Siebert entwickelte sich die Vitos Orthopädische Klinik Kassel zu einem der größten Endoprothetikzentren Deutschlands. Pro Jahr werden durchschnittlich 600 künstliche Kniegelenke, 500 Hüft- und 100 Schultergelenkprothesen eingesetzt. Der auch international angesehene und geschätzte Professor für Orthopädie und Orthopädische Chirurgie engagiert sich auch bei Aus- und Weiterbildung des medizinischen Nachwuchses und lehrt an der Philipps-Universität Marburg.